一項(xiàng)名為CancerSEEK的新的血液檢測(cè)方法可以鑒定8種常見(jiàn)癌癥：卵巢癌，肝癌，食道癌，胰腺癌，胃癌，結(jié)直腸癌，肺癌和汝腺癌。

        CancerSEEK測(cè)量16個(gè)基因的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)以及8個(gè)蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物。

        研究人員表示，將選定的生物標(biāo)志物聯(lián)合使用以進(jìn)行早期癌癥檢測(cè)，有可能改變篩查癌癥的方式，并且基于使用藥物組合來(lái)治療癌癥的相同原理。

        未來(lái)，血液檢查可以用來(lái)早期發(fā)現(xiàn)癌癥，以便通過(guò)手術(shù)來(lái)治療。即使是不能通過(guò)手術(shù)治愈的癌癥，當(dāng)疾病發(fā)展緩慢的時(shí)候，對(duì)全身治療的反應(yīng)也會(huì)更好。

        這項(xiàng)研究于2018年1月18日在線發(fā)表在Science上。

        研究試驗(yàn)還在初期。要真正確立CancerSEEK的臨床實(shí)用性并證明其可以拯救生命，就需要對(duì)大量人群中所有癌癥類型進(jìn)行前瞻性研究。

        這項(xiàng)研究為多種類型的癌癥的單一、多分析物血液檢驗(yàn)奠定了概念和實(shí)踐基礎(chǔ)。

        研究人員估計(jì)，這個(gè)單一測(cè)試的成本將低于500美元。如果情況確實(shí)如此，那么這種血液檢查較便宜和方便，相對(duì)于目前的篩查檢查，如結(jié)腸鏡檢查和乳房X光檢查。

CancerSEEK

        這項(xiàng)分類方法的一個(gè)新穎之處在于它將觀察到的各種DNA突變可能性與幾種蛋白質(zhì)水平結(jié)合起來(lái)，以便做出后結(jié)果。

        從初研究數(shù)百個(gè)基因和41種可能在轉(zhuǎn)移之前檢測(cè)到癌癥的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物開(kāi)始，研究人員就對(duì)16個(gè)基因的區(qū)段進(jìn)行了研究，并分析了8種蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物水平。

        這8種蛋白質(zhì)是癌抗原125，癌胚抗原，癌抗原19-9，催乳素，肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子，骨橋蛋白，過(guò)氧化物酶和金屬蛋白酶1組織抑制劑。

        CancerSEEK的個(gè)組成部分是從血樣中獲得的ctDNA的突變。研究人員從血漿中純化DNA，使用強(qiáng)大的61-擴(kuò)增子板多重聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增樣本，檢測(cè)血漿ctDNA中預(yù)期的罕見(jiàn)突變。

        設(shè)計(jì)了61對(duì)引物，從16個(gè)基因中擴(kuò)增目標(biāo)區(qū)域的66至80個(gè)堿基對(duì)的DNA片段。用DNA條形碼*地標(biāo)記擴(kuò)增的產(chǎn)物，并將其與癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)中的體細(xì)胞突變目錄中存在的參考序列或預(yù)測(cè)為在腫瘤抑制細(xì)胞中失活突變的參考序列匹配。

        研究人員表示，保持突變體小是必要的，以盡量減少假陽(yáng)性結(jié)果。

        CancerSEEK的第二個(gè)組成部分是確定8個(gè)癌癥蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物的水平。據(jù)研究人員介紹，將這種成分結(jié)合混合物的原因是因?yàn)?ldquo;早期腫瘤不能釋放可檢測(cè)量的ctDNA，即使使用敏感的技術(shù)來(lái)鑒定它們”。

        所選的8種蛋白質(zhì)可以通過(guò)單一免疫測(cè)定平臺(tái)進(jìn)行重復(fù)評(píng)估。

CancerSEEK

        研究人員招募了1,005例I～I(xiàn)II期卵巢、肝臟、食道、胰腺、胃、結(jié)直腸、肺、或乳房未曾手術(shù)的癌癥患者?；颊叩闹形荒挲g為64歲。常見(jiàn)的階段是癌癥II期(49%);20%患者癌癥I期;31%患者癌癥III期。

        該研究還包括812名沒(méi)有癌癥病史的健康人(中位年齡55歲)作為對(duì)照人群。

        如果患者曾接受過(guò)新輔助治療，切除后確定患有IV期疾病，或在麻醉狀態(tài)下抽取了血液，這些患者則被排除在研究之外。

        在癌癥患者接受手術(shù)切除前采集外周血。

        使用CancerSEEK血液檢測(cè)來(lái)檢測(cè)16個(gè)基因的2001基因組位置中的突變。使用確定39種蛋白質(zhì)(包括8種蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物)水平8組進(jìn)行基于Luminex珠為基礎(chǔ)的免疫測(cè)定。

        如果16個(gè)基因之一的突變頻率或8個(gè)蛋白之一或其組合之一的突變頻率相對(duì)于對(duì)照群體顯著升高，則將患者的檢測(cè)結(jié)果分類為陽(yáng)性。

        該算法然后使用機(jī)器學(xué)習(xí)工具和統(tǒng)計(jì)分析來(lái)確定10次的10倍交叉驗(yàn)證的中位敏感性和特異性。

        研究人員指出，篩查的重要的特征之一是能夠在早期發(fā)現(xiàn)癌癥。

        CancerSEEK的中位敏感性對(duì)于II期癌癥為73%，對(duì)于III期癌癥為78%，對(duì)于I期癌癥為43%。

        對(duì)于I期癌癥，高敏感性是肝癌(100%)，低是食管癌(20%)。

        8種常見(jiàn)癌癥的中位總敏感性為70%，這8中癌癥占美國(guó)癌癥死亡人數(shù)的60%以上。敏感性卵巢癌高為98%，汝腺癌低為33%。

        目前尚沒(méi)有進(jìn)行篩查檢查的癌癥為卵巢癌、肝癌、胃癌、胰腺癌和食管癌 ，敏感度在69%?98%之間。

        CancerSEEK的特異性> 99%，在812名健康人的對(duì)照人群中有7人發(fā)現(xiàn)陽(yáng)性得分。

        研究人員表示，對(duì)于檢測(cè)為陽(yáng)性的7名健康個(gè)體，這些結(jié)果被假定為假陽(yáng)性。然而，他們可能患有一種未確診的癌癥，且無(wú)癥狀。

確定癌癥起源組織

        為了確定陽(yáng)性CancerSEEK檢驗(yàn)結(jié)果的患者的起源組織，研究人員設(shè)計(jì)了一種算法，其考慮了ctDNA，8種蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物中的任何一種的水平以及由免疫測(cè)定法小組確定的31種其他蛋白質(zhì)的水平，和病人的性別。在這項(xiàng)分析中，食管癌和胃癌患者被歸類在一起，因?yàn)閮煞N情況下內(nèi)窺鏡檢查都是佳的隨訪方法。

        這種算法應(yīng)用在626例CancerSEEK評(píng)分陽(yáng)性癌癥患者上，且沒(méi)有使用任何其他信息。研究人員能夠?qū)⒒颊叩钠鹪唇M織定位在在兩個(gè)解剖部位的中位數(shù)為83%的患者，單個(gè)器官的為中位數(shù)為63%患者。

        研究人員表示，鑒于驅(qū)動(dòng)基因突變通常不是組織特異性的，絕大多數(shù)的定位信息都來(lái)源于蛋白質(zhì)標(biāo)記。結(jié)直腸癌的準(zhǔn)確性高(84%)，肺癌低(39%)。

        這種多分析物測(cè)試并不意味著其取代其他非血液基礎(chǔ)的篩查測(cè)試，如汝腺癌或結(jié)腸直腸癌的篩查，而是提供更多信息，幫助識(shí)別可能患有惡性腫瘤的患者。